Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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