Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms