Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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