Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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