Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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