Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms