Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms