Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPSQ13938 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms