Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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