Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms