Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKD2Q13563 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms