Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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