Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms