Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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NR1H3Q13133 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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