Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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TRAF1Q13077 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
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TRAF1Q13077 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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TRAF1Q13077 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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TRAF1Q13077 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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