Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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