Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms