Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms