Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms