Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms