Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms