Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN12Q05209 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms