Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms