Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms