Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFAMQ00059 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms