Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EEF1A1P68104 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EEF1A1P68104 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms