Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms