Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM3BP58499 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms