Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms