Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms