Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms