Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPAP53621 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPAP53621 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPAP53621 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms