Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TTPAP49638 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTPAP49638 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTPAP49638 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTPAP49638 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTPAP49638 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTPAP49638 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTPAP49638 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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