Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMPHP49418 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMPHP49418 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMPHP49418 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPHP49418 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPHP49418 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPHP49418 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms