Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms