Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDKN1BP46527 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms