Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RANGAP1P46060 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms