Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPOP42166 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPOP42166 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPOP42166 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPOP42166 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPOP42166 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPOP42166 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms