Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms