Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms