Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPDP35247 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms