Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC9P31274 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms