Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms