Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF1BP20333 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms