Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTRB1P17538 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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