Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF3P17036 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF3P17036 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms