Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFTRP13569 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFTRP13569 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFTRP13569 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFTRP13569 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFTRP13569 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms