Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms