Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMC1P11047 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms