Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLUP10909 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms